Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8005F6YKY3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms