Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm8247F6VRJ8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms