Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Zfp988F6VKC7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Zfp988F6VKC7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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