Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rdh16f1E9Q9P8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms