Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col22a1E9Q7P1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms