Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc85cE9Q6B2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms