Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc8E9PWG2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms