Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms