Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms