Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Phf11cB4XVP9 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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