Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usf3B2RUQ2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms