Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PtprbB2RU80 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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