Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms