Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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