Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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