Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sfrp4Q9Z1N6 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sfrp4Q9Z1N6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms