Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms