Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zeb2Q9R0G7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms