Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nek3Q9R0A5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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