Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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