Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rdh11Q9QYF1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms