Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nphp1Q9QY53 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms