Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mkrn1Q9QXP6 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mkrn1Q9QXP6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mkrn1Q9QXP6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Mkrn1Q9QXP6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Mkrn1Q9QXP6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mkrn1Q9QXP6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mkrn1Q9QXP6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mkrn1Q9QXP6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mkrn1Q9QXP6 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Mkrn1Q9QXP6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mkrn1Q9QXP6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mkrn1Q9QXP6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Mkrn1Q9QXP6 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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