Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mid2Q9QUS6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mid2Q9QUS6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms