Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Col5a3Q9JLI2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Col5a3Q9JLI2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col5a3Q9JLI2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms