Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mrpl39Q9JKF7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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