Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ube3bQ9ES34 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ube3bQ9ES34 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ube3bQ9ES34 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms