Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Slc28a3Q9ERH8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms