Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rnft1Q9DCN7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms