Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hmgn3Q9DCB1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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