Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rnf6Q9DBU5 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rnf6Q9DBU5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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