Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Pop5Q9DB28 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pop5Q9DB28 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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