Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40655-201ENSMUST00000220802 1880 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms