Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cldn22Q9D7U6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms