Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Nop56Q9D6Z1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Nop56Q9D6Z1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Nop56Q9D6Z1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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