Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms