Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pfn4Q9D6I3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms