Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hspb11Q9D6H2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms