Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc9bQ9D6E4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms