Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pabpc6Q9D4E6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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