Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cfap53Q9D439 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cfap53Q9D439 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms