Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx29Q9D3S3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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