Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rufy3Q9D394 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms