Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zbed3Q9D0L1 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zbed3Q9D0L1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zbed3Q9D0L1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zbed3Q9D0L1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zbed3Q9D0L1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Zbed3Q9D0L1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Zbed3Q9D0L1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms