Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms