Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nip7Q9CXK8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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