Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rpusd4Q9CWX4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms