Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkrip1Q9CWV6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkrip1Q9CWV6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms