Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CWU4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q9CWU4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms