Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pfdn1Q9CWM4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Pfdn1Q9CWM4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pfdn1Q9CWM4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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